متن پیام حضرت آیت‌الله خامنه‌ای به این شرح است:

«بسم الله الرحمن الرحیم

درگذشت عالم مجاهد مرحوم حجة‌الاسلام آقای حاج شیخ علی برهان رحمة‌الله علیه را که بخش عمده‌ئی از عمر خود را در خدمت انقلاب سپری کرد و سال‌ها در سنگر امامت جمعه به خدمات دینی و اجتماعی اشتغال داشت، به عموم مردم مؤمن و انقلابی مهریز و بخصوص به خانواده و بازماندگان محترم ایشان تسلیت عرض می‌کنم و رحمت و غفران الهی را برای ایشان مسألت می‌کنم.
  ۱۵ / فروردین / ۹۶»

عصر تعادل